Sequenzierung

Sequenzierung

DNA-Sequenzierung ist eine Schlüsseltechnologie der modernen Pflanzenwissenschaften mit vielfältigen Einsatzgebieten:

  • Sequenzierung vollständiger Pflanzengenome,
  • funktionelle Genomanalyse durch Genexpressionssequenzierung,
  • Systematische Erfassung epigenetischer Information in Genomen,
  • Charakterisierung der räumlichen Anordnung der DNA in Zellkernen und Chromosomen, sowie
  • die systematische sequenzbasierte Genotypisierung von Sammlungen genetischer Ressourcen.

Die Forschung vieler Arbeitsgruppen des IPK sowie Forschung im Rahmen wissenschaftlicher Kooperationen profitiert von der IPK-internen, zentralen Hochdurchsatzsequenzierplattform; angegliedert an die Forschungsgruppe „Genomik Genetischer Ressourcen“ (GGR). Hier stehen die aktuellsten Sequenziertechnologien der 2. und 3. Generation zur Verfügung, die im Rahmen der institutseigenen Investionsplanung sowie durch die Einwerbung von EU Fördermitteln (EFRE) beschafft wurden.

Das DNA-Sequenzierlabor ist eng mit der Informatikinfrastruktureinheit verzahnt und als solches Bestandteil des bio-digitalen Ressourcenzentrums des IPKs.